مسجد ثامن الائمه و مرکز اسلامی کیش در زمینی به مساحت ۳۳۰۰ متر مربع و با زیربنایی حدود ۲۶۰۰ متر مربع در سه طبقه شامل: زیر زمین دارای سالن چند منظوره اعم از حسینیه، محل اجتماعات و برگزاری مناسبات، آشپزخانه و وضوخانه و در طبقه همکف شامل شبستان اصلی مسجد رواقهای شرقی و غربی و وضوخانه و طبقه فوقانی شامل شبستان خواهران و رواقهای طرفین و اتاقهای مرکز اسلامی و آموزش قرآن قرار گرفته است.